萨摩耶犬的眼睛颜色一般有蓝色、淡褐色、榛色、杏色和浅棕色。其中最受欢迎的是蓝色,但也有金色、浅棕色和榛色。深褐色的眼睛或眼睛内有色环属于缺陷。蓝色眼睛最为理想,颜色越深越好。但眼圈的蓝色较浅而呈现出棕色阴影则不被认可。
萨摩耶犬的耳朵大小适中,呈三角形,尖端略圆。当它们站立时,耳朵直立,略向前倾;警惕时,耳朵会竖立,呈半直立状态。它们的外耳应该能够自由转动,耳朵上的毛发不能太长。如果萨摩耶犬的耳朵是下垂的,那么表明这只狗的健康存在问题。此外,萨摩耶犬还必须具备完整的耳朵,没有缺口或者畸形。